25-06-2022
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Directorio Académico

 
Investigador
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 Negrón Mendoza, Alicia
Resumen curricular

Investigadora del Departamento de Química de Radicaciones y Radioquímica desde 1976.

Es química fármaco-bióloga (1969) y doctora en química orgánica por la UNAM (1980)  realizando parte de sus estudios en la Universidad de Maryland bajo la tutela del Prof. Cyril Ponnamperuma. Es fundadora y responsable del Laboratorio de Evolución Química del ICN en 1976.

Publica artículos en revistas arbitradas reconocidas internacionalmente, ha presentado sus trabajos de investigación en eventos científicos nacionales e internacionales. Es docente y ha graduado estudiantes de licenciatura y posgrado en el área de Química, Biología y Ciencias del Tierra. Es responsable de varios proyectos PAPIIT y CONACyT y obtuvo el Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz (UNAM) por su desempeño académico (2008).

Sus investigaciones están relacionadas con la  estabilidad de moléculas de importancia prebiótica y biológica en ambientes extremos de radiación y temperatura y el posible papel que los minerales  juegan en dichos procesos. Sus estudios se han enfocado a la adsorción de ácidos carboxílicos, nitrilos, aldehidos, componentes de los ácidos nucléicos, aminoácidos irradiados sobre superficies  minerales como arcillas, calcita y otros minerales, como  agentes promotoros de reacciones que posiblmente  contribuyeron en procesos de evolución química. En el laboratorio de Evolución Química se estudian la radiólisis, sonólisis y termolisis de compuestos de importancia prebiotica en el contexto de evolución química, tanto a temperatura ambiente, como a bajas temperaturas simulando cometas o bien a temperaturas muy altas de posibles ambintes hidrotermales, se estudian aspectos de la quiralidad  y el efecto de la radiación en compuestos orgánicos quirales de importancia prebiótica adsorbidos en un mineral o en meteoritas como la meteorita Allende.

Materias que imparte
  • Fisicoquímica (Licenciatura)
  • Química de Ciencias de la Tierra (Licenciatura)
  • Química Orgánica (Licenciatura)
  • Química Orgánica-Biología (Licenciatura)
  • Química-Biología (Licenciatura)
  • Química Orgánica-Biología (Licenciatura)
  • Espectrometría de Masas (Posgrado)
  • Evolución Química (Especialización)
  • Química (Licenciatura)
  • Química Analítica Instrumental (Licenciatura)
  • Química de Radiaciones (Posgrado)
  • Química de Radiaciones en Sólidos (Maestría)
  • Química de Radicales Libres (Posgrado)
  • Tema Selecto de Ciencias Espaciales: Química de Radiaciones de Compuestos con Relevancia Astrobiológica (Maestría)
  • Aplicaciones de la Interacción Radiación-Materia (Doctorado)
  • Química de Radiaciones (Maestría)
  • Química de Radiaciones (Doctorado)
  • Química General (Licenciatura)
  • Química Orgánica (Licenciatura)
  • Seminario de Investigación I (Maestría)
  • Taller de Investigación en Ciencias Espaciales I (Licenciatura)
Líneas de investigación
Aplicaciones de las propiedades de sólidos a evolución química y dosimetría, Cambios en las propiedades en sólidos irradiados, Estudios de química de radiaciones enfocados a la evolución química, Interacción de radiación con materia, Química de radiaciones
Premios, reconocimientos y distinciones
  • Medalla (ICN 2018)
  • Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz (UNAM 2008)
Proyectos
Título del proyecto Institución que financia Cobertura
Estabilidad de compuestos Bio-órganicos en ambientes con altas temperaturas y presiones: Simulación de ventilas hidrotermales como posibles sitios de volución químicaPAPIITInstitucional
Simulación de ambientes primigenios para la formación y estabilidad de compuestos de importancia biológica: relevancia en procesos de evolución química CONACyTInstitucional
CHIRGEN: Chiralité et Genes, la quiralidad de los genesCONACyTInternacional
Estudios de evolución química en química de radiacionesICNInstitucional
The Chirality of Genes (CHIRGEN)MixtoInternacional
Modelos de microambientes sedimentarios en la evolución química y su relevancia en la evolución geobiológicaCONACyTInstitucional
Química y mineralogía prebiótica de la tierra y Marte durante el hadeano en presencia de agua líquidaPAPIITInstitucional
Mecanismos de protección de moléculas bio-orgánicas simulando microambientes de la tierra primitivaPAPIITInternacional
Reacciones inducidas por radiacion gamma en compuestos de importancia pre-biológica y biológicaMixtoInstitucional
Irradiación de compuestos orgánicos absorbidos en superficies minerales y su relevancia en la evolución químicaDGAPAInstitucional
Adsorción de aminoácidos irradiados sobre superficies de calcita como promotora de evolución químicaPAPIITInstitucional
Radiolisis y termolisis de compuestos de importancia prebiotica en el contexto de evolucion quimicaPAPIITInstitucional
LA QUIRALIDAD DE LOS GENESCONACyTInternacional
Efecto de la radiacion en compuestos organicos quirales de importancia prebiotica adsorbidos en un mineralPAPIITInstitucional
La quiralidad de los genesCONACyTInternacional
PE206918 Desarrollo de experimento de cátedra y problemario como un recurso adicional para mejorar el proceso de enseñanzaPAPIMELocal
Simulacion de ambientes primigenios: formacion y estabilidad de compuestos bio-organicos en procesos de evolucion quimicaPAPIITInstitucional
Mecanismos de protecci6n de moleculas de importancia prebi6tica en experimentos simulando ambientes primigenios. Relevancia en astrobiologfaPAPIITLocal
Selección de publicaciones
Estudiantes y postdocs
Postdoctorado

Nombre Actividades
Gómez Espinosa, Ma. CatalinaPlan: 1. ANÁLISIS DE LAS MUESTRAS Las muestras de Rincón de Parangueo serán analizadas por microscopía (óptica) tanto de los sedimentos como de las muestras de biofilmes para establecer la identidad de la comunidad microbiana, distribución de microorganismos en relación a los sedimentos, y la microestructura de los carbonatos precipitados. Una vez realizada esta descripción, se podrá documentar la biodiversidad microbiana de los depósitos de carbonato del BSI utilizando las técnicas disponibles para estudiar detalladamente los biofilmes. Al mismo tiempo, se harán estudios para definir las interacciones microbio-mineral y entender el papel de las cianobacterias en la disolución de los minerales carbonatados; esta caracterización se realizará inicialmente por medio de microscopía (de luz transmitida y por medio de microscopía de barrido electrónico). a. Análisis petrográficos Se elaborarán secciones delgadas de las muestras, éstas serán analizadas en un microscopio petrográfico de contraste de fases y con luz polarizada para realizar la descripción mineralógica de las mismas. También se realizarán estudios por difracción de rayos X para la identificación de fases cristalinas cualitativa y cuantitativamente. Por otro lado, de manera complementaria se hará un análisis por microscopía electrónica (análisis por microsonda) ya que es el método más utilizado para realizar análisis semicuantitativo y cuantitativo de fases minerales. b. Análisis químico general Una alícuota de las muestras será molida y se procederá a analizarla por métodos estándar en ciencia del suelo. Se hará ladeterminación de la materia orgánica en las muestras por distintos métodos. En primer lugar por permanganometría, usada normalmente para la extracción de carbono orgánico lábil o pasivo. Otro método que será usado es la calcinación para determinar indirectamente la cantidad de materia orgánica presente en la muestra. Se realizará también la determinación de carbonatos en el suelo, por el método de retrotitulación del ión hidronio, que se basa en la descomposición de carbonatos en dióxido de carbono. También se llevará a cabo un análisis elemental de las muestras. c. Extracción de biomarcadores Las muestras de sedimentos se pulverizarán en un molino de bolas (Instituto de Geología, UNAM) para poder realizar la extracción de marcadores químicos. Las técnicas de extracción dependen del tipo de moléculas que se estén buscando. Lípidos. Las muestras serán sumergidas en una mezcla de diclorometano:metanol (2:1) y serán sonicadas durante una hora. Los extractos se filtrarán y el sobrenadante será evaporado por vacío. Se realizará una resuspensión de las muestras y se analizará por cromatografía de gases-espectrometría de masas. Los compuestos serán analizados usado el catálogo del cromatógrafo y en caso de ser posible, por la comparación con estándares. Proteínas. En el caso de proteínas las muestras se tratarán con cloruro de guanidinio (GuHCl) uno de los agentes más potentes para desnaturalizar proteínas. Las muestras serán incubadas con una solución que contenga GuHCl y EDTA por distintos tiempos y temperaturas, pasado este tiempo serán dializadas, liofilizadas y se analizarán para determinar sus propiedades. 2. EXPERIMENTOS Se prepararán muestras en las que se mezclarán los minerales seleccionados con algunas moléculas orgánicas (i.e. azúcares, oligopéptidos, bases nitrogenadas) y se someterán a la acción de distintas condiciones físico-químicas para evaluar la resiliencia de las moléculas ante factores externos. Entre las condiciones que se pretende evaluar están los cambios de temperatura, exposición a fuentes de radiación, cambios de concentración de iones en el medio, cambios de pH. Se propone hacer una desorción de los compuestos orgánicos y analizarlos por las correspondientes técnicas analíticas. La fase mineral será estudiada por microscopía (AFM, electrónica de barrido), RX, espectroscopía de IR, con el fin de evaluar si hubo un cambio en su estructura. 3. MODELOS COMPUTACIONALES Se modelarán las interacciones de las moléculas orgánicas con la fase mineral, con el programa Hyperchem. Con estos modelos es posible encontrar valores termodinámicos que expliquen los procesos de adsorción y descomposición de las muestras al interaccionar con el mineral.
Gómez Espinosa, Ma. CatalinaPlan: 1. ANÁLISIS DE LAS MUESTRAS Las muestras de Rincón de Parangueo serán analizadas por microscopía (óptica) tanto de los sedimentos como de las muestras de biofilmes para establecer la identidad de la comunidad microbiana, distribución de microorganismos en relación a los sedimentos, y la microestructura de los carbonatos precipitados. Una vez realizada esta descripción, se podrá documentar la biodiversidad microbiana de los depósitos de carbonato del BSI utilizando las técnicas disponibles para estudiar detalladamente los biofilmes. Al mismo tiempo, se harán estudios para definir las interacciones microbio-mineral y entender el papel de las cianobacterias en la disolución de los minerales carbonatados; esta caracterización se realizará inicialmente por medio de microscopía (de luz transmitida y por medio de microscopía de barrido electrónico). a. Análisis petrográficos Se elaborarán secciones delgadas de las muestras, éstas serán analizadas en un microscopio petrográfico de contraste de fases y con luz polarizada para realizar la descripción mineralógica de las mismas. También se realizarán estudios por difracción de rayos X para la identificación de fases cristalinas cualitativa y cuantitativamente. Por otro lado, de manera complementaria se hará un análisis por microscopía electrónica (análisis por microsonda) ya que es el método más utilizado para realizar análisis semicuantitativo y cuantitativo de fases minerales. b. Análisis químico general Una alícuota de las muestras será molida y se procederá a analizarla por métodos estándar en ciencia del suelo. Se hará ladeterminación de la materia orgánica en las muestras por distintos métodos. En primer lugar por permanganometría, usada normalmente para la extracción de carbono orgánico lábil o pasivo. Otro método que será usado es la calcinación para determinar indirectamente la cantidad de materia orgánica presente en la muestra. Se realizará también la determinación de carbonatos en el suelo, por el método de retrotitulación del ión hidronio, que se basa en la descomposición de carbonatos en dióxido de carbono. También se llevará a cabo un análisis elemental de las muestras. c. Extracción de biomarcadores Las muestras de sedimentos se pulverizarán en un molino de bolas (Instituto de Geología, UNAM) para poder realizar la extracción de marcadores químicos. Las técnicas de extracción dependen del tipo de moléculas que se estén buscando. Lípidos. Las muestras serán sumergidas en una mezcla de diclorometano:metanol (2:1) y serán sonicadas durante una hora. Los extractos se filtrarán y el sobrenadante será evaporado por vacío. Se realizará una resuspensión de las muestras y se analizará por cromatografía de gases-espectrometría de masas. Los compuestos serán analizados usado el catálogo del cromatógrafo y en caso de ser posible, por la comparación con estándares. Proteínas. En el caso de proteínas las muestras se tratarán con cloruro de guanidinio (GuHCl) uno de los agentes más potentes para desnaturalizar proteínas. Las muestras serán incubadas con una solución que contenga GuHCl y EDTA por distintos tiempos y temperaturas, pasado este tiempo serán dializadas, liofilizadas y se analizarán para determinar sus propiedades. 2. EXPERIMENTOS Se prepararán muestras en las que se mezclarán los minerales seleccionados con algunas moléculas orgánicas (i.e. azúcares, oligopéptidos, bases nitrogenadas) y se someterán a la acción de distintas condiciones físico-químicas para evaluar la resiliencia de las moléculas ante factores externos. Entre las condiciones que se pretende evaluar están los cambios de temperatura, exposición a fuentes de radiación, cambios de concentración de iones en el medio, cambios de pH. Se propone hacer una desorción de los compuestos orgánicos y analizarlos por las correspondientes técnicas analíticas. La fase mineral será estudiada por microscopía (AFM, electrónica de barrido), RX, espectroscopía de IR, con el fin de evaluar si hubo un cambio en su estructura. 3. MODELOS COMPUTACIONALES Se modelarán las interacciones de las moléculas orgánicas con la fase mineral, con el programa Hyperchem. Con estos modelos es posible encontrar valores termodinámicos que expliquen los procesos de adsorción y descomposición de las muestras al interaccionar con el mineral.
Cruz Castañeda, Jorge ArmandoInvestigación Posdoctoral
Vázquez López, Héctor GilbertoTrabajo en modelado molecular Divulgación de conocimientos de biología molecular y microbiología Consultor de código Python y labor docente
Tesis de licenciatura y posgrado

Título Estudiante Grado académico
Estabilidad de algunas bases nitrogenadas en un sistema que simula una ventila hidrotermalCruz Castañeda, Jorge ArmandoDoctorado
Estabilidad del ácido alfa cetoglutárico en condiciones primigenias probables en medios terrestres y extraterrestresRamírez Vázquez, María LuisaDoctorado
Estudio de cristales de halogenuros alcalinos dopados con cationes divalentes ante radiación gammaOrtíz Morales, AlejandroDoctorado
Formación y descomposición de algunas moléculas orgánicas detectadas en cometas y su relación con el origen de la vidaLópez Islas, AnayellyDoctorado
Implicaciones biológicas del material orgánico complejo formado en simulaciones de laboratorio de núcleos cometariosColín García, MaríaDoctorado
Simulación de ambientes primigenios para la formación y estabilidad de compuestos de importancia biológica: relevancia en evolución químicaMeléndez López, Adriana LeticiaDoctorado
Influencia de las superficies minerales en el desarrollo y estabilización de moléculas orgánicas en condiciones prebióticasAguilar Ovando, Ellen YvetteDoctorado
Evaluación de la dosimetría termoluminiscente del cristal CaSO4:Dy expuesto a radiación gamma a bajas temperaturasHernández Medina, AntonioMaestría
Modelos de microambientes sedimentarios para la protección de moléculas bio-orgánicas en la tierra primitiva : estudio con montmorillonita de sodio y nucleósidosAguilar Ovando, EllenMaestría
Estudio sobre la adsorción de bases púricas y pirimidicas, y sus correspondientes derivados de ribosa en montmorillonita de sodio en el contexto de origen de la vidaPerezgasga Ciscomani, LucíaMaestría
Estudio de estabilidad de aldehídos y cetonas ante campos energéticos en la tierra primitivaFuentes Carreón, Claudio AlejandroMaestría
Radiólisis de bases nitrogenadas complementarias y su co-adsorción en arcillas: implicaciones en química prebióticaRamírez Carreón, JessicaMaestría
Simulación de microambientes primitivos: radiólisis de bases púricas y pirimídicas en presencia de una arcillaGuzmán Marmolejo, AndrésMaestría
El sistema sulfato ferroso amoniacal sólido como dosimetro para procesos a bajas temperaturas y altas dosis de radiación gammaJuárez Calderón, Jose ManuelMaestría
Estudio de la estabilidad de gliceraldehído en campos altos de radiación gamma: relevancia en la tierra primitiva y en cuerpos extraterrestresFuentes Carreón, Claudio AlejandroLicenciatura
Dosimetría a bajas temperaturasRamoz Amezquita, AlejandroLicenciatura
Influencia de una arcilla en la radiólisis de adenina simulando microambientes primitivosGuzmán Malmolejo, AndrésLicenciatura
Estabilidad de la guanina y citosina en disolución acuosa y suspensión con montmorillonita sódica: simulaciones de charcas en la tierra primitivaParedes Arriaga, AlejandroLicenciatura
Estudios de evolución química sobre la adsorción de adenina y poli A en una arcillaSerrato Díaz, AlejandraLicenciatura
Síntesis prebiótica de compuestos orgánicos reducidos a partir de la irradiación GAMMA de formatos Vega Arreguín, Julio CésarLicenciatura
Reacciones en el ácido behenico inducidas por temperatura y radiación gamma adsorbido en una arcillaCruz Castañeda, Jorge ArmandoLicenciatura
Efectos de la presencia de la montmorillonita de sodio en la radiólisis del ácido succinico y sus posibles implicaciones en evolución químicaColín García, MaríaLicenciatura
Sitio de adsorción de guanina en montmorillonita de sodioMeléndez López, Adriana LeticiaLicenciatura
Radiólisis del ácido acético en medio acuoso y en presencia de caolinita y sus implicaciones en evolución químicaZamora Saldívar, BetzabeLicenciatura